Косвенные затраты в себестоимость продукции представлены следующими комплексными статьями: Расходы на содержание и эксплуатацию оборудования, общепроизводственные и общехозяйственные расходы, коммерческие расходы. Анализ этих расходов производится путем сравнения их фактической величины на рубль продукции в динамики за 5-10 лет, а также с плановым уровнем отчетного. Данное сравнение показывает, как изменилась их доля в стоимости продукции в динамики и по сравнению с планом,  и какая наблюдается тенденция – роста или снижения.
В процессе последующего анализа выясняют причины, вызвавшие абсолютное и относительное изменение косвенных затрат.  По своему составу это комплексные статьи, которые состоят, как правило, из нескольких элементов затрат.
Расходы на содержание и эксплуатации машин и оборудования включают амортизацию машин и технологического оборудования, затраты на их ремонт, эксплуатацию, расходы по внутризаводскому перемещению грузов и т.д. Некоторые виды затрат (например, амортизация) не зависят от объема производства продукции и являются условно-постоянными. Другие полностью или частично зависят от его изменения и являются  условно-переменными.
Общая сумма амортизации зависит от количества машин и оборудования, их структуры, стоимости и норм амортизации. Стоимость оборудования может измениться за счет приобретения более дорогих  машин и их переоценки в связи с инфляцией. Норма амортизации изменяются довольно редко и как правило, по решению правительства. Удельная амортизация на единицу продукции зависит еще от  объема производства продукции. Чем больше продукции выпущено на данных производственных мощностях, тем меньше амортизация и других постоянных затрат приходится на единицу продукции.
На величину эксплутационных расходов влияют количество действующего оборудования, время его работы  и удельные расходы на один машино-час работы.
Для анализа общепроизводственных и общехозяйственных расходов по статьям затрат используют данные аналитического бухгалтерского учета, где по каждой статье выявляют абсолютное и относительное отклонение от плана и их причины.
В процессе анализа должны быть выявлены непроизводственные затраты, потери от бесхозяйственности излишеств, которые можно рассматривать как неиспользованные резервы снижения себестоимости продукции.
Непроизводственными затраты следует считать потери от порчи и недостачи сырья (материалов) и готовой продукции, оплату простоев по вине предприятия, доплаты за это время в связи с использование рабочих на работах, требующих менее квалифицированного труда, стоимость потребленных энергии и топлива за время простоев предприятия и др.
Коммерческие расходы включают затраты по отгрузке продукции покупателям (погрузочно-разгрузочные работы, доставка) расходы на тару и упаковочные материалы, рекламу, изучение рынков сбыта и т.д
Расходы по доставке товаров зависят от расстояния перевозки, веса перевезенного груза, транспортных тарифов за перевозку  грузов, вида транспортных средств. Расходы по погрузке и выгрузке могут изменяться в связи с изменением веса отгруженной продукции и расценок за погрузку и выгрузку одной тонны продукции.